130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1102 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  49.23 
 
 
1207 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 
787 aa  1593    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  65.18 
 
 
817 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  47.22 
 
 
1187 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  45.65 
 
 
941 aa  247  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  39.22 
 
 
535 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  40.62 
 
 
544 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.5 
 
 
1147 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.3 
 
 
792 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  37.53 
 
 
454 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  40.15 
 
 
778 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.15 
 
 
784 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.86 
 
 
837 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  38.01 
 
 
447 aa  210  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  37.91 
 
 
776 aa  208  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  40 
 
 
602 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.95 
 
 
553 aa  177  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  37.08 
 
 
389 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.22 
 
 
554 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  43.22 
 
 
326 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.72 
 
 
477 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.27 
 
 
579 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.18 
 
 
561 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.04 
 
 
556 aa  144  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.6 
 
 
567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.35 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  32.05 
 
 
449 aa  142  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  33.55 
 
 
376 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  33.97 
 
 
593 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.96 
 
 
570 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.55 
 
 
555 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  40.47 
 
 
618 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  33.16 
 
 
558 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  32.42 
 
 
569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.72 
 
 
563 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.97 
 
 
577 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.53 
 
 
818 aa  134  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.77 
 
 
821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  32.51 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.81 
 
 
555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.98 
 
 
553 aa  131  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.53 
 
 
554 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.1 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  31.68 
 
 
566 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.47 
 
 
558 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30 
 
 
1848 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  31.81 
 
 
911 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.38 
 
 
810 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.37 
 
 
1919 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  27.7 
 
 
743 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.81 
 
 
1679 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.02 
 
 
2082 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  28.12 
 
 
461 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  32.22 
 
 
681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.2 
 
 
403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.49 
 
 
341 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.95 
 
 
900 aa  111  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
745 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.48 
 
 
835 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.13 
 
 
575 aa  107  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.44 
 
 
717 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.97 
 
 
737 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.62 
 
 
396 aa  104  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  30.77 
 
 
443 aa  104  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.75 
 
 
706 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  24.55 
 
 
461 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  28.05 
 
 
1129 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.68 
 
 
363 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  42.42 
 
 
133 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  27.59 
 
 
714 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.68 
 
 
363 aa  96.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  30.27 
 
 
638 aa  94.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  27.39 
 
 
726 aa  94  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 
547 aa  92.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.39 
 
 
692 aa  91.3  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 
728 aa  91.3  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.02 
 
 
469 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  34.91 
 
 
643 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.06 
 
 
807 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.16 
 
 
14609 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.76 
 
 
1222 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.11 
 
 
418 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  30.14 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.07 
 
 
450 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  27.27 
 
 
547 aa  80.5  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  28.41 
 
 
558 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.84 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.32 
 
 
328 aa  79  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  28.83 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  26.69 
 
 
783 aa  78.2  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  30.97 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  34.21 
 
 
390 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.67 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.43 
 
 
727 aa  70.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  25.71 
 
 
590 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  29.14 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  24.42 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.24 
 
 
2816 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>