124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1101 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  49.09 
 
 
817 aa  707    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  47.47 
 
 
787 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
1187 aa  2363    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  66.08 
 
 
1207 aa  1531    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.36 
 
 
784 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.42 
 
 
778 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.63 
 
 
837 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.41 
 
 
792 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.31 
 
 
776 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  45.92 
 
 
941 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.57 
 
 
535 aa  288  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  44.94 
 
 
602 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  43.48 
 
 
544 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  47.15 
 
 
454 aa  258  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  43.65 
 
 
447 aa  257  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.16 
 
 
1147 aa  240  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.66 
 
 
821 aa  239  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.16 
 
 
818 aa  227  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  54.36 
 
 
326 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.1 
 
 
553 aa  202  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.93 
 
 
2082 aa  185  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  35.73 
 
 
389 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.1 
 
 
743 aa  172  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.45 
 
 
717 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.9 
 
 
593 aa  164  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  27.78 
 
 
911 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.5 
 
 
554 aa  148  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.83 
 
 
714 aa  148  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.42 
 
 
579 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.06 
 
 
551 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.24 
 
 
556 aa  141  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.93 
 
 
618 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  34.57 
 
 
376 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.27 
 
 
569 aa  138  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.49 
 
 
570 aa  138  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  32.42 
 
 
449 aa  137  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.32 
 
 
810 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  33.82 
 
 
341 aa  137  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.8 
 
 
561 aa  136  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.58 
 
 
546 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.71 
 
 
555 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.32 
 
 
1848 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  31.73 
 
 
477 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.38 
 
 
563 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.36 
 
 
554 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.12 
 
 
577 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.72 
 
 
567 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  25.24 
 
 
14609 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.55 
 
 
560 aa  125  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
745 aa  124  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  33.61 
 
 
553 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  31.08 
 
 
558 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.55 
 
 
558 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  35.67 
 
 
681 aa  118  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.67 
 
 
900 aa  117  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.61 
 
 
443 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.53 
 
 
1919 aa  116  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.22 
 
 
417 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.25 
 
 
1222 aa  116  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.81 
 
 
396 aa  114  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.24 
 
 
555 aa  113  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.17 
 
 
1679 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  29.82 
 
 
566 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.97 
 
 
575 aa  105  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.64 
 
 
726 aa  105  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  23.87 
 
 
728 aa  105  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.12 
 
 
835 aa  104  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  29.46 
 
 
363 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  29.46 
 
 
363 aa  104  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.91 
 
 
403 aa  103  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.46 
 
 
807 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  44.88 
 
 
133 aa  101  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  28.17 
 
 
461 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.9 
 
 
737 aa  99.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  26.93 
 
 
461 aa  98.6  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.7 
 
 
469 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  29.79 
 
 
638 aa  97.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.19 
 
 
418 aa  95.5  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  29.1 
 
 
328 aa  92.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.61 
 
 
499 aa  92  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  30.55 
 
 
643 aa  89.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  28.11 
 
 
783 aa  87  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.6 
 
 
706 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.89 
 
 
1129 aa  86.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30.16 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  28.13 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.49 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  29.47 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.57 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.54 
 
 
692 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 
547 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  29.06 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  77.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.77 
 
 
1126 aa  75.5  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.42 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  30.77 
 
 
394 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.59 
 
 
727 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25 
 
 
921 aa  73.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  27.75 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  25.99 
 
 
590 aa  72  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>