114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1045 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  100 
 
 
454 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  43.5 
 
 
1207 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  42.89 
 
 
1187 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  42.7 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  40.05 
 
 
544 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.23 
 
 
941 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  39.04 
 
 
817 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.19 
 
 
787 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.58 
 
 
535 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  38.11 
 
 
792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  38.77 
 
 
602 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  36.11 
 
 
778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.66 
 
 
326 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.69 
 
 
837 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  37.72 
 
 
784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  37.72 
 
 
776 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.03 
 
 
1147 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.16 
 
 
553 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  32.75 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.6 
 
 
477 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.56 
 
 
579 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.07 
 
 
818 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.98 
 
 
556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  32.69 
 
 
376 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.35 
 
 
561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.33 
 
 
810 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  30.37 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  28.83 
 
 
577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.41 
 
 
554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.59 
 
 
341 aa  117  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.7 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.02 
 
 
821 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.99 
 
 
593 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.42 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  27.88 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  29.81 
 
 
569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  52.34 
 
 
133 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  30.98 
 
 
618 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  27.42 
 
 
558 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.76 
 
 
555 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  28.89 
 
 
743 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.87 
 
 
551 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.53 
 
 
570 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.77 
 
 
555 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  33.06 
 
 
560 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.92 
 
 
1848 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.72 
 
 
567 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  32.15 
 
 
745 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.31 
 
 
566 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.81 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  28.64 
 
 
2082 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.17 
 
 
835 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.32 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.89 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.3 
 
 
1919 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  28.69 
 
 
554 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  26.88 
 
 
911 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.3 
 
 
900 aa  86.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  32.46 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  30.53 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.09 
 
 
1679 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.38 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  24.73 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.47 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.44 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.91 
 
 
14609 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  28.24 
 
 
783 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.86 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.2 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  30.35 
 
 
638 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.07 
 
 
726 aa  77  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  34.76 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  26.91 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.29 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.78 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  24.46 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.11 
 
 
547 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.4 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.92 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  27.3 
 
 
737 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.76 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.12 
 
 
1222 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.49 
 
 
807 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.73 
 
 
706 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  26.69 
 
 
461 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  25.54 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.25 
 
 
692 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.8 
 
 
727 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.77 
 
 
728 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.62 
 
 
624 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.95 
 
 
1126 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  25 
 
 
590 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  30.24 
 
 
547 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  35.06 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  33.54 
 
 
1312 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  25.14 
 
 
643 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  24.2 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.73 
 
 
643 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  30.82 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>