68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1000 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  66.51 
 
 
1637 aa  1143    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  100 
 
 
1420 aa  2786    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  81.99 
 
 
1545 aa  1630    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  64.71 
 
 
1503 aa  1140    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  75.27 
 
 
755 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  59.48 
 
 
486 aa  224  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0797  hypothetical protein  82.83 
 
 
241 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  36.65 
 
 
1393 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  26.81 
 
 
1333 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  37.71 
 
 
1090 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  42.05 
 
 
1627 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  24.2 
 
 
1442 aa  97.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  43.28 
 
 
3036 aa  96.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  27.62 
 
 
1343 aa  84.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  41.67 
 
 
1137 aa  75.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  39.6 
 
 
1219 aa  69.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  43.53 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  43.59 
 
 
922 aa  67.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  42.47 
 
 
935 aa  65.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  38.98 
 
 
1448 aa  63.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  38.37 
 
 
1217 aa  62.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  38.89 
 
 
643 aa  62  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  61.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  36.11 
 
 
1309 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  37.84 
 
 
1126 aa  61.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  38.64 
 
 
534 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  39.74 
 
 
405 aa  59.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  41.3 
 
 
1058 aa  58.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  44.19 
 
 
1403 aa  59.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  35.15 
 
 
1200 aa  58.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.91 
 
 
913 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  45.33 
 
 
1086 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  34.64 
 
 
909 aa  58.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  46.58 
 
 
495 aa  57.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  41.57 
 
 
309 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  39.44 
 
 
280 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.59 
 
 
630 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  43.06 
 
 
386 aa  55.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  39.53 
 
 
224 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  34.78 
 
 
1202 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  39.39 
 
 
1333 aa  53.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  36.14 
 
 
1198 aa  53.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  37.62 
 
 
620 aa  53.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  35.58 
 
 
866 aa  52.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  41.89 
 
 
274 aa  52  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  52  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 
756 aa  51.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 
554 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  36.84 
 
 
239 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  38.53 
 
 
896 aa  50.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.1 
 
 
1137 aa  50.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  31.4 
 
 
449 aa  50.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.89 
 
 
974 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  41.43 
 
 
968 aa  49.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  33.93 
 
 
1109 aa  49.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  38.96 
 
 
313 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  21.74 
 
 
786 aa  48.5  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  35.65 
 
 
639 aa  48.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  38.55 
 
 
582 aa  48.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  37.14 
 
 
243 aa  48.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  30.58 
 
 
432 aa  47  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  35.09 
 
 
693 aa  47  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  21.74 
 
 
871 aa  47  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  55.56 
 
 
632 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  34.67 
 
 
258 aa  46.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  35.71 
 
 
456 aa  45.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  32.5 
 
 
503 aa  45.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.84 
 
 
954 aa  45.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>