More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0897 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  100 
 
 		 647 aa  1314    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  80.52 
 
 		 650 aa  1030    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  80.06 
 
 		 650 aa  1024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  37.07 
 
 		 674 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  36.13 
 
 		 851 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  36.97 
 
 		 633 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  36.91 
 
 		 631 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  36.97 
 
 		 633 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.71 
 
 		 957 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.15 
 
 		 927 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  35.65 
 
 		 659 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  35.15 
 
 		 646 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  36.41 
 
 		 635 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  28.53 
 
 		 832 aa  343  7e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.67 
 
 		 960 aa  342  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.84 
 
 		 934 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  36.02 
 
 		 643 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  36.1 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.82 
 
 		 944 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.46 
 
 		 707 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  34.2 
 
 		 646 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  32.62 
 
 		 843 aa  331  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.2 
 
 		 921 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  32.06 
 
 		 636 aa  329  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.33 
 
 		 713 aa  326  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  33.13 
 
 		 651 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  33.57 
 
 		 843 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  36.5 
 
 		 681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  32.37 
 
 		 876 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.12 
 
 		 921 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.6 
 
 		 725 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.98 
 
 		 660 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  34.86 
 
 		 629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.68 
 
 		 644 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.47 
 
 		 930 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  32.91 
 
 		 840 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  32.85 
 
 		 725 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  32.92 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  33.38 
 
 		 668 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  31.45 
 
 		 709 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  33.91 
 
 		 838 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  36.27 
 
 		 675 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  32.42 
 
 		 662 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.82 
 
 		 929 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  34.37 
 
 		 652 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.26 
 
 		 646 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  34.1 
 
 		 674 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.04 
 
 		 929 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  34.1 
 
 		 659 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.67 
 
 		 743 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.38 
 
 		 653 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  34.29 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  33.95 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.05 
 
 		 651 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.16 
 
 		 646 aa  312  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  34.14 
 
 		 669 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  34.14 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  34.4 
 
 		 641 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.68 
 
 		 658 aa  310  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  33.95 
 
 		 659 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  33.99 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  33.89 
 
 		 661 aa  308  3e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  34.21 
 
 		 652 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  36.8 
 
 		 649 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.18 
 
 		 934 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.23 
 
 		 641 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  30.43 
 
 		 822 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  33.18 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.18 
 
 		 934 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.44 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  34.09 
 
 		 634 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.74 
 
 		 639 aa  303  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.87 
 
 		 639 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.9 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  36.25 
 
 		 649 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.28 
 
 		 636 aa  301  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.47 
 
 		 934 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.47 
 
 		 934 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.28 
 
 		 636 aa  300  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.03 
 
 		 934 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  34.06 
 
 		 675 aa  299  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.03 
 
 		 934 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  34.06 
 
 		 675 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.03 
 
 		 934 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  31.78 
 
 		 755 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  33.44 
 
 		 634 aa  297  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.27 
 
 		 934 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  32.99 
 
 		 665 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.87 
 
 		 636 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 		 934 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.87 
 
 		 934 aa  296  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.87 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>