More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0709 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  100 
 
 		 650 aa  1328    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  99.08 
 
 		 650 aa  1315    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  80.06 
 
 		 647 aa  1038    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  37.75 
 
 		 851 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  37.13 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  36.68 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  31.23 
 
 		 832 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  36.8 
 
 		 631 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  36.14 
 
 		 640 aa  362  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  37.27 
 
 		 633 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  35.52 
 
 		 729 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  33.75 
 
 		 876 aa  360  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  36.24 
 
 		 633 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.9 
 
 		 957 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  34.29 
 
 		 840 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.35 
 
 		 927 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  35.26 
 
 		 646 aa  350  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  33.65 
 
 		 636 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  34.36 
 
 		 713 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  35.2 
 
 		 646 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  35.79 
 
 		 635 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.72 
 
 		 725 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  33.49 
 
 		 651 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.54 
 
 		 643 aa  337  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.43 
 
 		 725 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 		 934 aa  336  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.2 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.2 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  34.44 
 
 		 743 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  36.73 
 
 		 645 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.84 
 
 		 639 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.13 
 
 		 707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.33 
 
 		 660 aa  327  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.7 
 
 		 921 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  30.31 
 
 		 822 aa  326  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  33.29 
 
 		 838 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.98 
 
 		 644 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.93 
 
 		 651 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.37 
 
 		 646 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.08 
 
 		 653 aa  321  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.1 
 
 		 673 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.31 
 
 		 641 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  33.18 
 
 		 662 aa  320  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.49 
 
 		 658 aa  319  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.78 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.17 
 
 		 668 aa  319  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  32.68 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  34.95 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  34.11 
 
 		 634 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  34.37 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 		 921 aa  317  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  34.68 
 
 		 641 aa  317  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.95 
 
 		 930 aa  316  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  36.64 
 
 		 649 aa  316  8e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  31.66 
 
 		 709 aa  316  9e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.6 
 
 		 929 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.89 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  34.05 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  34.22 
 
 		 669 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  34.22 
 
 		 669 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  33.19 
 
 		 754 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.9 
 
 		 639 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.27 
 
 		 646 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  33.93 
 
 		 640 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.74 
 
 		 636 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  34.05 
 
 		 661 aa  310  6.999999999999999e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  33.93 
 
 		 633 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  33.83 
 
 		 659 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  34.1 
 
 		 675 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  33.33 
 
 		 664 aa  308  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  34.1 
 
 		 675 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  32.24 
 
 		 751 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  34.83 
 
 		 699 aa  307  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  33.68 
 
 		 674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.63 
 
 		 639 aa  306  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.56 
 
 		 634 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.56 
 
 		 634 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.18 
 
 		 639 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.72 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  33.68 
 
 		 659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.04 
 
 		 934 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  31.82 
 
 		 755 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  32.73 
 
 		 755 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  32.42 
 
 		 634 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  34.19 
 
 		 641 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  33.44 
 
 		 652 aa  303  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.9 
 
 		 934 aa  303  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  35.42 
 
 		 665 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>