More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0548 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03832  translation elongation factor G1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08110)  53.49 
 
 		 799 aa  754    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.19 
 
 		 692 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1049  elongation factor G  63.88 
 
 		 695 aa  950    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00560945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0544  elongation factor G  50.57 
 
 		 694 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.372581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  49.49 
 
 		 692 aa  645    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  49.43 
 
 		 699 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  50.58 
 
 		 691 aa  662    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0548  translation elongation factor G  100 
 
 		 695 aa  1436    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  48.57 
 
 		 694 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  48.57 
 
 		 694 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01520  elongation factor g 1, mitochondrial precursor (mef-g-1), putative  53.89 
 
 		 811 aa  753    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2166  translation elongation factor G  54.35 
 
 		 710 aa  765    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  50.22 
 
 		 700 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  48.78 
 
 		 704 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  49.05 
 
 		 689 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.22 
 
 		 696 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  48.55 
 
 		 692 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  50.44 
 
 		 691 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4918  translation elongation factor G  49.35 
 
 		 699 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  49.49 
 
 		 698 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  49.57 
 
 		 699 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000485563  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  49.64 
 
 		 703 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  48.12 
 
 		 692 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  48.56 
 
 		 698 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  48.42 
 
 		 698 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  50.58 
 
 		 691 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  49.43 
 
 		 696 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  49.27 
 
 		 692 aa  636    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  50 
 
 		 692 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32800  predicted protein  58.85 
 
 		 700 aa  808    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2292  elongation factor G  74.24 
 
 		 694 aa  1086    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  49.2 
 
 		 698 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  47.81 
 
 		 692 aa  636    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  50.58 
 
 		 691 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  48.63 
 
 		 692 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  49.93 
 
 		 704 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  50.07 
 
 		 702 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000179981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  49.85 
 
 		 691 aa  657    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1583  elongation factor G  74.1 
 
 		 694 aa  1085    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  50.14 
 
 		 697 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39465  predicted protein  53.43 
 
 		 745 aa  742    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000000268657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1934  elongation factor G  65.01 
 
 		 693 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2813  elongation factor G  73.96 
 
 		 695 aa  1075    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115924  normal  0.668258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  48.98 
 
 		 692 aa  649    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  49.35 
 
 		 700 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  48.22 
 
 		 697 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  50.07 
 
 		 702 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  50.07 
 
 		 702 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1660  elongation factor G  73.99 
 
 		 695 aa  1081    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.264114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  49.64 
 
 		 697 aa  647    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  48.69 
 
 		 691 aa  654    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  48.35 
 
 		 699 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  49.28 
 
 		 699 aa  645    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2784  elongation factor G  65.75 
 
 		 696 aa  976    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  50.43 
 
 		 700 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  49.27 
 
 		 691 aa  649    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1778  translation elongation factor G  49.78 
 
 		 682 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.57 
 
 		 703 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0550  elongation factor G  63.87 
 
 		 693 aa  926    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.276809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  48.78 
 
 		 698 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  49.28 
 
 		 699 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  48.09 
 
 		 693 aa  641    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  48.04 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  48.04 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  47.78 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  48.1 
 
 		 691 aa  635  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  48.13 
 
 		 698 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000280538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  48.28 
 
 		 700 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  47.61 
 
 		 692 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  49.34 
 
 		 690 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  47.84 
 
 		 704 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.69 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  48.06 
 
 		 700 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  47.53 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3828  elongation factor G  49.93 
 
 		 704 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000816604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  49.06 
 
 		 699 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  49.79 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.83 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  49.14 
 
 		 700 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  47.54 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.97 
 
 		 692 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  47.35 
 
 		 704 aa  628  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  49.14 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  49.14 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  49.14 
 
 		 700 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>