More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0512 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
315 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  38.11 
 
 
500 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 
497 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
497 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
484 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.06 
 
 
566 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
282 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  34.87 
 
 
566 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 
557 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  38.59 
 
 
262 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  38.63 
 
 
288 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 
556 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 
568 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
568 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
545 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
301 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  32.82 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  30.32 
 
 
307 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  31.16 
 
 
306 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 
556 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
313 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
290 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 
278 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  29.74 
 
 
562 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
559 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
303 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
258 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
303 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  32.02 
 
 
284 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
317 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
310 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
310 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
303 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
267 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
268 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  28.73 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
262 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  30.38 
 
 
264 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.8 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  29.62 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  31.21 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  31.37 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 
264 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  29.59 
 
 
315 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  29.87 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  28.18 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
260 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  28.42 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  28.91 
 
 
294 aa  85.9  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  29.67 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  29.08 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  29.43 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  27.3 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  27.3 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.17 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  32.72 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.3 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.76 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  25.6 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>