More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0509 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  715    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.06 
 
 
377 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  62.9 
 
 
361 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  59.89 
 
 
360 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.63 
 
 
356 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.63 
 
 
356 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.63 
 
 
356 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  58.17 
 
 
396 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  59.13 
 
 
389 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.21 
 
 
353 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.34 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  58.52 
 
 
366 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.91 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  56.46 
 
 
355 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.62 
 
 
357 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.18 
 
 
357 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.98 
 
 
375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  57.31 
 
 
375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  57.99 
 
 
376 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  53.35 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  49.26 
 
 
339 aa  324  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.4 
 
 
361 aa  322  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  56.39 
 
 
355 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 
343 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50.83 
 
 
363 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.68 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.51 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 
376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 
340 aa  302  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 
362 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 
356 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.46 
 
 
367 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.69 
 
 
363 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 
348 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.62 
 
 
362 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  44.09 
 
 
377 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  48.63 
 
 
384 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.47 
 
 
344 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.17 
 
 
362 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 
364 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.35 
 
 
367 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 
377 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  48.61 
 
 
375 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  49.58 
 
 
361 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  55.11 
 
 
354 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52 
 
 
378 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.35 
 
 
363 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.66 
 
 
356 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.91 
 
 
378 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 
355 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  47.27 
 
 
356 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.31 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.31 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.43 
 
 
357 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.58 
 
 
393 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  52.68 
 
 
367 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  49.17 
 
 
363 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 
356 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.56 
 
 
349 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  49.17 
 
 
363 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.71 
 
 
354 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.72 
 
 
392 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.31 
 
 
352 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.77 
 
 
336 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.71 
 
 
354 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  51.18 
 
 
340 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  48.61 
 
 
348 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  48.52 
 
 
357 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  47.01 
 
 
364 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.64 
 
 
364 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 
356 aa  275  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.75 
 
 
340 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  47.48 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.58 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.47 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.18 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
348 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  49.01 
 
 
348 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 
342 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.56 
 
 
354 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 
354 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.63 
 
 
358 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 
364 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.16 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.88 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.23 
 
 
385 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.64 
 
 
364 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.77 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 
351 aa  268  8e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 
360 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
351 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 
359 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.55 
 
 
351 aa  265  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>