More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0503 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 298 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  47.33 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  47.33 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  46.98 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  47.84 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  39.36 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  37.3 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  38.3 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.35 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  37.13 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  34.52 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  35.92 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  31.29 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  33.46 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 		 535 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  34.02 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  34.63 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 534 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0853  protoheme IX farnesyltransferase  34.28 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0839  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0816  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  34.88 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 		 324 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  34.82 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  35.15 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  34.42 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  34.06 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  34.16 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  34.06 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  34.16 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  36.62 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  34.95 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  35.34 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  37.41 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  36.62 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>