More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0458 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  50.66 
 
 
1071 aa  1135    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  50.7 
 
 
1049 aa  1134    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  52.03 
 
 
1062 aa  1149    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  51.52 
 
 
1062 aa  1137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  50.14 
 
 
1066 aa  1135    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  51.51 
 
 
1065 aa  1149    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  100 
 
 
1138 aa  2316    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  51.75 
 
 
1062 aa  1146    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  51.94 
 
 
1062 aa  1148    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  47.12 
 
 
1078 aa  978    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  48.5 
 
 
1113 aa  1072    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  46.8 
 
 
1084 aa  1081    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  51.18 
 
 
1062 aa  1134    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  51.18 
 
 
1062 aa  1135    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  50.47 
 
 
1060 aa  1135    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  51.72 
 
 
1069 aa  1152    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  47.37 
 
 
1062 aa  979    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  51.95 
 
 
1067 aa  1152    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  51.23 
 
 
1062 aa  1132    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  47.71 
 
 
1111 aa  1055    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  51.87 
 
 
1062 aa  1145    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  51.39 
 
 
1081 aa  1149    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  49.09 
 
 
598 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  55.27 
 
 
445 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.56 
 
 
1052 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  27.19 
 
 
1040 aa  234  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.54 
 
 
1005 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.89 
 
 
1042 aa  231  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.62 
 
 
1042 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.48 
 
 
1059 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.82 
 
 
1031 aa  187  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.67 
 
 
1014 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.64 
 
 
1010 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.17 
 
 
1097 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.23 
 
 
666 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  29.7 
 
 
686 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.88 
 
 
459 aa  101  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.98 
 
 
423 aa  96.3  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  26.45 
 
 
440 aa  95.9  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.08 
 
 
431 aa  95.5  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.2 
 
 
438 aa  94  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.45 
 
 
470 aa  90.9  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  24.61 
 
 
1167 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.93 
 
 
433 aa  89.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.62 
 
 
438 aa  89.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.38 
 
 
1082 aa  88.2  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.95 
 
 
585 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  24.58 
 
 
1067 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.94 
 
 
1090 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  26.88 
 
 
702 aa  85.9  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.48 
 
 
717 aa  85.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.92 
 
 
428 aa  84.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.62 
 
 
674 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.71 
 
 
421 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.76 
 
 
667 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.39 
 
 
496 aa  84  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.84 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.84 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.18 
 
 
670 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.05 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  25.22 
 
 
478 aa  82  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  24.89 
 
 
451 aa  82  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.34 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  23.89 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.04 
 
 
426 aa  80.9  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.99 
 
 
430 aa  80.1  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  24.7 
 
 
455 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.95 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.8 
 
 
426 aa  79  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  32.35 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.36 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.28 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.12 
 
 
819 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.35 
 
 
590 aa  78.2  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.47 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  30.05 
 
 
956 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.64 
 
 
432 aa  77  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.76 
 
 
436 aa  76.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  32.08 
 
 
444 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.01 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.01 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.49 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.45 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.97 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  24.94 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.45 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.49 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  27.87 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  30.2 
 
 
443 aa  74.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  30.2 
 
 
443 aa  74.3  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.65 
 
 
440 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.17 
 
 
427 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25 
 
 
692 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.01 
 
 
434 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.55 
 
 
407 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.17 
 
 
445 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.44 
 
 
1084 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.46 
 
 
429 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>