More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0415 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  100 
 
 		 357 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0838  transport system permease protein  48.42 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.59 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.2 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  40 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.57 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.88 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.97 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.67 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  40.64 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.19 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  45.91 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  39.45 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  39.58 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.61 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.46 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.21 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  37.66 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.62 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.85 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.67 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  41.13 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.75 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  36.54 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  40 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.46 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.38 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.88 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  36 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  38.35 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.52 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  38.55 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  37.63 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.92 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.91 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.41 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  39.65 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.58 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.58 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  37.03 
 
 		 344 aa  186  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.07 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.9 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.31 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.6 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.25 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  36.5 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.05 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  40.36 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.83 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  41.58 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.95 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.64 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  39.16 
 
 		 345 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  41.34 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.07 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.33 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3575  transport system permease protein  44.22 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  38.71 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  38.59 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  36.24 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.49 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.53 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  42.65 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  39.56 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  45.32 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.14 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  36.62 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.28 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  43.68 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  36.33 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  43.12 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.78 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.93 
 
 		 346 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.73 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.15 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  40.21 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  44.29 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  37.31 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.87 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.87 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  38.97 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  37.72 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  34.48 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  37.32 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.03 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.97 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  38.83 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  40.48 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  35.33 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  44.04 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  36.57 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  38.51 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  38.79 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0115  transport system permease protein  36.61 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>