More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0390 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  100 
 
 
397 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  65.24 
 
 
403 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  64.45 
 
 
397 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  59.35 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  62.44 
 
 
419 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  61.03 
 
 
407 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  61.6 
 
 
403 aa  511  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  61.21 
 
 
403 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 
406 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 
406 aa  501  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  61.03 
 
 
400 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  58.75 
 
 
402 aa  501  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  61.64 
 
 
397 aa  502  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  61.35 
 
 
402 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  59.34 
 
 
401 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  58.91 
 
 
399 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  59.75 
 
 
404 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  59.25 
 
 
408 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  59.05 
 
 
405 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  59.09 
 
 
404 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  58 
 
 
409 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  59.5 
 
 
407 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  57.54 
 
 
406 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  57.8 
 
 
406 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  58.06 
 
 
406 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  58.67 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  59.5 
 
 
414 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  60.2 
 
 
399 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  58.65 
 
 
412 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  58.75 
 
 
406 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  60.2 
 
 
399 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  58 
 
 
405 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  56.5 
 
 
406 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
412 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  57.5 
 
 
405 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  57.5 
 
 
405 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
405 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  57.64 
 
 
411 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  58.42 
 
 
396 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  56.64 
 
 
408 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
405 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
405 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  58.75 
 
 
406 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
405 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
405 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  57.68 
 
 
403 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  56.12 
 
 
406 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  55.84 
 
 
406 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  56.64 
 
 
406 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  56.75 
 
 
406 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  56.75 
 
 
406 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  56.38 
 
 
408 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  57 
 
 
405 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  56.5 
 
 
406 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  57.82 
 
 
409 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  57.95 
 
 
402 aa  477  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  57 
 
 
406 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 
419 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  55.14 
 
 
407 aa  475  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  57.46 
 
 
408 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  57.46 
 
 
408 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  57.76 
 
 
407 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  55.39 
 
 
407 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  59 
 
 
413 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  56.6 
 
 
401 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  59.1 
 
 
412 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  58.15 
 
 
413 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  58.59 
 
 
410 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 
405 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 
410 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  57.07 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  57.04 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  55.89 
 
 
405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  57.46 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  56.14 
 
 
409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  58.5 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  58.67 
 
 
409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  59 
 
 
413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
408 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 
416 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  56.2 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  55.89 
 
 
410 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 
404 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  56.97 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 
409 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
409 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  57.89 
 
 
413 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  55.73 
 
 
419 aa  464  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  56.36 
 
 
409 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  54.89 
 
 
407 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
407 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  57 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  56.86 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  54.89 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>