139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0335 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
454 aa  914    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  49.19 
 
 
454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
404 aa  276  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  38.41 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  38.5 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  35.68 
 
 
427 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  37.07 
 
 
427 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  36.83 
 
 
427 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  36.83 
 
 
427 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  37.07 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  36.83 
 
 
427 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  36.83 
 
 
427 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  36.83 
 
 
427 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  36.83 
 
 
427 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  36.83 
 
 
427 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  36.25 
 
 
427 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  32.23 
 
 
437 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
439 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
412 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  35.33 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  35.52 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  34.5 
 
 
474 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  37.21 
 
 
453 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  36.6 
 
 
453 aa  226  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 
450 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  33.97 
 
 
425 aa  224  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  35.4 
 
 
451 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  35.44 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  34.02 
 
 
443 aa  222  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
469 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  35.03 
 
 
446 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  31.8 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  35.01 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
424 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
572 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  30.68 
 
 
439 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  32.4 
 
 
441 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
451 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 
458 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  32.17 
 
 
431 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  28.54 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
469 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 
442 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  30.73 
 
 
447 aa  186  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.34 
 
 
425 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
428 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
419 aa  180  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  28.86 
 
 
458 aa  179  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
421 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  34.04 
 
 
464 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  34.75 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.51 
 
 
416 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  33.79 
 
 
458 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.31 
 
 
435 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  29.22 
 
 
436 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.31 
 
 
460 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 
435 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
433 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  28.6 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  30.57 
 
 
430 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  27.02 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.68 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.26 
 
 
424 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.81 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  26.67 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  27.99 
 
 
426 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  29.63 
 
 
429 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26.52 
 
 
460 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  25.49 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  25.88 
 
 
462 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  24.66 
 
 
454 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.35 
 
 
426 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.73 
 
 
443 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  25.11 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.2 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  26.83 
 
 
437 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  26.25 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  24.95 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  25.97 
 
 
467 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  28.67 
 
 
449 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.12 
 
 
455 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  27.21 
 
 
460 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  24.65 
 
 
440 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  24.12 
 
 
456 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
445 aa  99.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  25.62 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  26.17 
 
 
440 aa  97.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>