More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0280 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  46.53 
 
 
305 aa  280  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
412 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.91 
 
 
310 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.68 
 
 
1131 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  36.24 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.24 
 
 
326 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.32 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.010948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.34 
 
 
443 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.46 
 
 
313 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
278 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.58 
 
 
441 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.78 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29 
 
 
443 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.62 
 
 
552 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.9 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.7 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.52 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  36.11 
 
 
229 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 
229 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.95 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.520966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.13 
 
 
229 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.5 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 
229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  34.97 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  34.97 
 
 
242 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 
236 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  34.97 
 
 
229 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  34.97 
 
 
229 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  34.97 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35 
 
 
229 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  35.52 
 
 
229 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  35.52 
 
 
229 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 
247 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 
262 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 
257 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 
234 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  27.63 
 
 
1111 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  35.33 
 
 
229 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  42.74 
 
 
247 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 
230 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 
234 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 
236 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44 
 
 
230 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 
246 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  43.8 
 
 
258 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 
259 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.09 
 
 
308 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 
247 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2216  two component transcriptional regulator  44.62 
 
 
234 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
390 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
236 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 
234 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1923  two component transcriptional regulator  44.62 
 
 
234 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 
246 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0945  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.57 
 
 
305 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  39.55 
 
 
1342 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 
223 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 
246 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
230 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  45.45 
 
 
236 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
231 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
225 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.02 
 
 
216 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 
249 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  41.32 
 
 
268 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  33.98 
 
 
269 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.29 
 
 
243 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
231 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 
229 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
230 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 
265 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 
225 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  40.5 
 
 
265 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 
234 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.01 
 
 
247 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.27 
 
 
231 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  32.97 
 
 
239 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 
226 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
225 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.17 
 
 
231 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  32.97 
 
 
239 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  44.07 
 
 
227 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.88 
 
 
231 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  40.5 
 
 
260 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  40.5 
 
 
260 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  37.68 
 
 
232 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
230 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 
228 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  40.5 
 
 
260 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.15 
 
 
230 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  39.57 
 
 
248 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 
260 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  33.97 
 
 
230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 
228 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  33.97 
 
 
230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  33.97 
 
 
230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>