More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0268 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  46.02 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  46.02 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 237 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  43.16 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  44.64 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  43.81 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  44.25 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  42.48 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  44.89 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.75 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  44.93 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.81 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  44.83 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.36 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  37.55 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.15 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  45.78 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  37.99 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  41.48 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>