More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0255 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  62.76 
 
 		 149 aa  184  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.24 
 
 		 144 aa  183  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  63.09 
 
 		 150 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 149 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  63.19 
 
 		 150 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 207 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 151 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.93 
 
 		 149 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  64.44 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  60.26 
 
 		 149 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 151 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 154 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.84 
 
 		 152 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 172 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 150 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  59.18 
 
 		 148 aa  170  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 150 aa  170  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 155 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 153 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  63.19 
 
 		 150 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 		 153 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 148 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.44 
 
 		 150 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 146 aa  168  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 144 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  49.4 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.48 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 148 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.05 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 150 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 146 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.7 
 
 		 146 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  55.8 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 159 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 151 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.42 
 
 		 150 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 150 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  52.6 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 		 148 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.96 
 
 		 147 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.98 
 
 		 152 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 151 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  56.49 
 
 		 144 aa  161  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 151 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 152 aa  161  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 145 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  55.7 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  55.7 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 141 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 150 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 157 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 147 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  158  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>