More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0253 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 551 aa  1076    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  41.26 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 591 aa  292  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.4 
 
 		 539 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  36.56 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 579 aa  276  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.79 
 
 		 604 aa  276  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 593 aa  273  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.38 
 
 		 594 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.22 
 
 		 356 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.31 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 375 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 350 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  45.9 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  34.25 
 
 		 350 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.54 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  43.01 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 359 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 367 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 367 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  43.13 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.16 
 
 		 369 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  35.85 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 372 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.42 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.44 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.3 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  45.51 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  38.66 
 
 		 368 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 362 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 362 aa  231  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.72 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 359 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  38.63 
 
 		 377 aa  230  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 		 370 aa  230  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 369 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.2 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 		 364 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  34.96 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 		 362 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 374 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 372 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 368 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  43.82 
 
 		 385 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 369 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 367 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 		 370 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 365 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  43.4 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  46.45 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  43.53 
 
 		 370 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  39.28 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  38.48 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  40.34 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.2 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 367 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  35.22 
 
 		 363 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  41.43 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  43.67 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 359 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.01 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41.07 
 
 		 366 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 365 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 371 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1562  3-dehydroquinate synthase  43.05 
 
 		 385 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.171072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 373 aa  220  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 366 aa  220  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 359 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  32.34 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  45.4 
 
 		 371 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 360 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  37.6 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 		 359 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 359 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>