More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0230 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 375 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  46.75 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  44.38 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.51 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  40.79 
 
 		 509 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  40.23 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  42.76 
 
 		 498 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  47.55 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  39.31 
 
 		 546 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  39.86 
 
 		 552 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  38.33 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  44.41 
 
 		 464 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  40.2 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  44.09 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  44.09 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  44.09 
 
 		 512 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  39.87 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.87 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  39.87 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  39.87 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  42.32 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  39.6 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  39.54 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  39.87 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  42.32 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  42.32 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  42.32 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  42.32 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  39.87 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  45.49 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  43.21 
 
 		 523 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  38.22 
 
 		 499 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  38.34 
 
 		 498 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  42.55 
 
 		 498 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  41.34 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  43.21 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  42.29 
 
 		 499 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.51 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  37.3 
 
 		 530 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  37.71 
 
 		 560 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  43.84 
 
 		 547 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.34 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  37.94 
 
 		 543 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.91 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.2 
 
 		 526 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  37.5 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.87 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.69 
 
 		 390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.52 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.89 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 477 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  41.86 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  41.86 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  40.12 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  37.25 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  42.77 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.97 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  28.57 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  28.77 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  29.27 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.57 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  30.4 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  28.01 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  29.39 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.69 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.96 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.58 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  24.73 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.21 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  28.43 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  27.82 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  28.88 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  27.76 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  29.48 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  27.76 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  29.49 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  27.76 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.42 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.48 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  26.73 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.4 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  26.33 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  27.91 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.01 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  24.73 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  30.56 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  31 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  23.74 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  24.37 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  26.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  27.76 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  23.4 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  23.4 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  23.4 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  23.4 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.8 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.46 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  27.4 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.4 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  29.01 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>