203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0208 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
103 aa  201  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.67 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.42 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  41.67 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  31.46 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  34.09 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  34.07 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  27.55 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.47 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  32.26 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  33.72 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  33.72 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  28.28 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 
100 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 
110 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  30.11 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.55 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  31.13 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.84 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.68 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  31.46 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.92 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  30.23 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  28.4 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  30.23 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0867  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.157195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.9 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.41 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
111 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.14 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.29 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.29 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 
151 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.41 
 
 
112 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.4 
 
 
111 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.14 
 
 
112 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  25.29 
 
 
111 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.47 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30.95 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>