17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0139 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0139  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  480  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  26.98 
 
 
285 aa  55.8  6e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.3 
 
 
220 aa  50.8  2e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  21.52 
 
 
283 aa  50.1  3e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  23.67 
 
 
273 aa  49.7  4e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.34 
 
 
209 aa  49.7  5e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  24.87 
 
 
244 aa  48.9  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  22.76 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  33.06 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  20.56 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  20.71 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  29.09 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  31.4 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  22.45 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  27.62 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  22.73 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  29.95 
 
 
296 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>