More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0136 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  50.22 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  50.22 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  53.73 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.06 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  49.75 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.5 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  47.76 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  47.76 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  46.77 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.17 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.08 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  47.74 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.89 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  48.46 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  45.21 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.39 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.39 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  42.41 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  43.72 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  42.27 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.05 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.26 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  40 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  40 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  40 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  42.52 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  42.79 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  39.82 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  40.44 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.54 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  41.47 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.64 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  41.47 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  41.26 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.7 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  38.74 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.26 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  39.46 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  40.18 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  38.96 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  38.96 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.74 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  39.64 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.82 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  40.18 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  41.1 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  39.19 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  40.54 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  43.2 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  41.1 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  39.19 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  41.2 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  40.54 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  41.2 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  40.54 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  41.2 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.33 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  40.54 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  39.46 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.47 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  41.28 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  37.56 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  41.94 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  38.86 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.36 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  40.21 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  41.59 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 		 308 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  41.7 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>