59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0099 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0099  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 768 aa  1535    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  26.77 
 
 		 385 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  30.5 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  31.76 
 
 		 370 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  31.76 
 
 		 345 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  31.08 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  22.06 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0270  general secretion pathway protein E  36.17 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156539  normal  0.222382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  27.92 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  27.92 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  31.16 
 
 		 479 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  37.5 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  34.04 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  34.04 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  30.89 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 834 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  33.33 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.91 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  22.68 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  23.91 
 
 		 567 aa  57  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  25.98 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 561 aa  54.7  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  29.46 
 
 		 568 aa  54.3  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.13 
 
 		 568 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 574 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.95 
 
 		 568 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.95 
 
 		 568 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.28 
 
 		 568 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 568 aa  51.2  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  29.69 
 
 		 277 aa  50.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  29.55 
 
 		 575 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  28.87 
 
 		 610 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.81 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.81 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 556 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  28.12 
 
 		 574 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.81 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  24.81 
 
 		 568 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.85 
 
 		 302 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  24.03 
 
 		 571 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  27.34 
 
 		 570 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  24.41 
 
 		 563 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 553 aa  47.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.03 
 
 		 568 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  27.87 
 
 		 888 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.52 
 
 		 958 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  28.21 
 
 		 574 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  23.62 
 
 		 562 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  22.95 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  24.31 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  24.19 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  30.53 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.03 
 
 		 493 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  23.02 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3723  General secretory system II protein E domain protein  21.83 
 
 		 866 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  28.12 
 
 		 277 aa  44.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  26.09 
 
 		 568 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>