44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0090 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0090  YceI family protein  100 
 
 		 175 aa  357  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  32.94 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  29.48 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  28.32 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5164  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  30.18 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  29.47 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  26.62 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2592  hypothetical protein  26.74 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  41.07 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  30.3 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  30.3 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  28.38 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  41.3 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  30.14 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  26.42 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  26.57 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.8 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  42.22 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  46.34 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.12 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.57 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  30.59 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  28.92 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  36.76 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  29.91 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  26 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  31.52 
 
 		 183 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  26.42 
 
 		 205 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  30.61 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  41.3 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  29.79 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  28.57 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  27.91 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  27.96 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.96 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>