More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0079 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1096    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  46.18 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 495 aa  326  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  44.31 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  38.68 
 
 		 512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  40.35 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  42.47 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  38.9 
 
 		 506 aa  306  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  39.65 
 
 		 506 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  41.73 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  37.03 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  38.76 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  38.81 
 
 		 504 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  38.49 
 
 		 536 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  38.98 
 
 		 506 aa  296  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  37.16 
 
 		 517 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  39.49 
 
 		 526 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  37.25 
 
 		 504 aa  293  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  39.72 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  37.16 
 
 		 508 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  37.85 
 
 		 539 aa  289  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  39.33 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  39.69 
 
 		 507 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  38.4 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  39.88 
 
 		 510 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  36.38 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 525 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  39.68 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  38.18 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  39.2 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  36.18 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  39.45 
 
 		 510 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 507 aa  283  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 559 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  38.17 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  37.64 
 
 		 511 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  36.42 
 
 		 505 aa  279  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  36.96 
 
 		 510 aa  279  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  35.96 
 
 		 506 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  38.67 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.99 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  38.28 
 
 		 504 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  37.52 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  41.09 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  37.86 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  36.67 
 
 		 547 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 499 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  36.42 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  36.4 
 
 		 504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 565 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  37.14 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 510 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 		 513 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  41.81 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  36.82 
 
 		 503 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  37.45 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.9 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 527 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 522 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 569 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  42.64 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 518 aa  260  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 490 aa  257  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  39.01 
 
 		 4930 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  36.14 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>