More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0049 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  100 
 
 
317 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  44.44 
 
 
317 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  43.85 
 
 
318 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  44.48 
 
 
316 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  44.72 
 
 
320 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  46.15 
 
 
322 aa  252  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  43.12 
 
 
322 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  41.72 
 
 
316 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  42.68 
 
 
316 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  41.77 
 
 
316 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  43.77 
 
 
320 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  43.53 
 
 
316 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  42.36 
 
 
319 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  42.9 
 
 
319 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  44.48 
 
 
319 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  42.9 
 
 
319 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  44.41 
 
 
320 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  44.73 
 
 
318 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  42.81 
 
 
334 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  44.09 
 
 
320 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  42.33 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  44.48 
 
 
319 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  45.37 
 
 
310 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  42.59 
 
 
319 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  42.5 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  44.59 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  41.96 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  45.54 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  43.45 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  42.95 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  42.43 
 
 
312 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  41.4 
 
 
315 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  41.35 
 
 
312 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  43.27 
 
 
318 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  43.85 
 
 
317 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  42.95 
 
 
316 aa  242  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  42.9 
 
 
317 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  43.81 
 
 
315 aa  242  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  42.68 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  42.14 
 
 
319 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  44.34 
 
 
323 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  41.32 
 
 
316 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  43.04 
 
 
324 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  41.82 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  40.45 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  39.68 
 
 
314 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  40.38 
 
 
317 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  40.76 
 
 
315 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  42.41 
 
 
315 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  42.41 
 
 
315 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  42.41 
 
 
315 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  42.41 
 
 
315 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  40.65 
 
 
312 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2440  glutathione synthetase  47.33 
 
 
307 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  43.12 
 
 
317 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  43.22 
 
 
317 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  42.16 
 
 
314 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  43.57 
 
 
318 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  40.13 
 
 
317 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  43.22 
 
 
317 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  43.09 
 
 
318 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  41.83 
 
 
316 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  40.65 
 
 
312 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  43.53 
 
 
317 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  42.01 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  41.29 
 
 
315 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  42.09 
 
 
315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  42.49 
 
 
315 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  40.71 
 
 
316 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  40.19 
 
 
315 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  40.19 
 
 
315 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.45 
 
 
317 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  45.51 
 
 
312 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  40.13 
 
 
315 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  45.51 
 
 
312 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  41.64 
 
 
317 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  42.28 
 
 
318 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  42.63 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  39.87 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  41.98 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  41.67 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  44.13 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  39.49 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  39.61 
 
 
315 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  41.77 
 
 
323 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  41.05 
 
 
318 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  41.77 
 
 
323 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>