More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0040 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  30.88 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  30.5 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  36.55 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0147  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 302 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 497 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 72 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  42.86 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 98 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  32 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  40 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>