More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0029 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 364 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  30.79 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  30.79 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.43 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  30.48 
 
 		 373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  33.52 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.73 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  30.29 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  31.49 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.83 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  32.25 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  42.94 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  44.52 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.29 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  43.87 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  44.87 
 
 		 362 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  43.87 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.7 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  31.87 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.24 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  31.73 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  32.14 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  33.67 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  39.25 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  41.51 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  40.49 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  41.51 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.54 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  40.44 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.4 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.96 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  29.44 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  38.78 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  32.56 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  41.58 
 
 		 361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  42.19 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.86 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  45.5 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  40.31 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.68 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.57 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  40.88 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  40.64 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  37.44 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.21 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.27 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  38.8 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  41.07 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  37.62 
 
 		 460 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  37.62 
 
 		 460 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  39.89 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  31.47 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.6 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.96 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  40.33 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.25 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.79 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  41.11 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 323 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.25 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.72 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 323 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  41.98 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.25 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.84 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.25 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  32.02 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.79 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  29.43 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  31.88 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  41.71 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  36.98 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.12 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  29.94 
 
 		 640 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  38.46 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.79 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  43.55 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.89 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  35.92 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.98 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  34.36 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.67 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>