146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0016 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  27.14 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.34 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  23.97 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  24.81 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  26.14 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  36.72 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  27.97 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  25.89 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  35.16 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  35.16 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  36.79 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  34.82 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  35.85 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  34.11 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  32.43 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  31.78 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  24.42 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  24.26 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  23.21 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  22.51 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  23.9 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  31.19 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  24.4 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  29.36 
 
 		 488 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  29.36 
 
 		 488 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  28.18 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.82 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  24.09 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  30.61 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.91 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  27.18 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  23.74 
 
 		 249 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  25.47 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  28.44 
 
 		 505 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  25.47 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  23.83 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  23.74 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  29.35 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.46 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  28.07 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  27.83 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.61 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  25.5 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  22.05 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.29 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.29 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.29 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  25.57 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  23.29 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  23.29 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1849  hypothetical protein  28.23 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  28.26 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  23.29 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25.87 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0356  FecR protein  28 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  29.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  25.77 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>