More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2383 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
435 aa  899    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  59.47 
 
 
449 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  55.41 
 
 
441 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 
437 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  54.15 
 
 
433 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  54.11 
 
 
437 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  52.36 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 
430 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  54.57 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  52.93 
 
 
433 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 
433 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
433 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  49.2 
 
 
430 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
433 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
433 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  51.18 
 
 
430 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  51.18 
 
 
430 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  51.18 
 
 
430 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  50.94 
 
 
430 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  50.47 
 
 
440 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 
449 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  50.12 
 
 
468 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  49.88 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  49.88 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  50.83 
 
 
443 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  47.19 
 
 
429 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 
433 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  47.18 
 
 
434 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  46.71 
 
 
434 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 
434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  47.18 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 
434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 
425 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 
419 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 
439 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 
423 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  43.79 
 
 
439 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 
431 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  50 
 
 
438 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.33 
 
 
439 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 
437 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 
431 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  43.56 
 
 
431 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  44.47 
 
 
438 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 
437 aa  359  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 
431 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.92 
 
 
437 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 
426 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.22 
 
 
435 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 
433 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 
424 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
436 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
440 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
428 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
428 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
428 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
428 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
428 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
428 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
428 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.94 
 
 
426 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
428 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
433 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  40.09 
 
 
428 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 
433 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.71 
 
 
426 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  40.71 
 
 
426 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
426 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.71 
 
 
426 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  40.71 
 
 
426 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
428 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.71 
 
 
426 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
435 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
426 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.47 
 
 
426 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  41.65 
 
 
427 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  41.75 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
434 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
435 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  44.16 
 
 
433 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  41.88 
 
 
427 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  41.41 
 
 
427 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
425 aa  340  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
430 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
428 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
427 aa  339  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  39.86 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  42.62 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 
427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
435 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
427 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
427 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
427 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>