76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2228 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  41.75 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.41 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.57 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.49 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.49 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.67 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.67 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.82 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.17 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  31.74 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  30.61 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  30.61 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.87 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.25 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  33.82 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  33.82 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.99 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  34.31 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  32.35 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.46 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.03 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  34.03 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  30.52 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.52 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.53 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.41 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.19 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  25.54 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.84 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  26.03 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 294 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.41 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  30.08 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.41 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.41 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.58 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.72 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  25.93 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  29.32 
 
 		 533 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  30.23 
 
 		 399 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.38 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0103  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  29.51 
 
 		 250 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  32.37 
 
 		 302 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  32.37 
 
 		 302 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.94 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  29.92 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4190  hypothetical protein  27.54 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  27.87 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.08 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.08 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.49 
 
 		 260 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.69 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  29.92 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  28.57 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  26.03 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  26.03 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  26.03 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  27.03 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.71 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  25.34 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  25.33 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  27.03 
 
 		 242 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>