More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2175 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  100 
 
 
245 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  70.78 
 
 
251 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  69.29 
 
 
243 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  69.29 
 
 
243 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  70.95 
 
 
248 aa  363  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  70.54 
 
 
248 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  67.22 
 
 
247 aa  350  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  65.56 
 
 
243 aa  345  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  65.56 
 
 
245 aa  344  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  63.07 
 
 
259 aa  343  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  65.83 
 
 
249 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.37 
 
 
243 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  63.37 
 
 
243 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  64.32 
 
 
247 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.37 
 
 
243 aa  339  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  63.79 
 
 
243 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  65.98 
 
 
248 aa  337  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  63.49 
 
 
242 aa  337  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  63.9 
 
 
243 aa  337  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  63.9 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  62.66 
 
 
242 aa  328  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  62.81 
 
 
247 aa  325  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  61.83 
 
 
243 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  62.81 
 
 
247 aa  325  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  63.14 
 
 
238 aa  325  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  61.34 
 
 
246 aa  325  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  61.83 
 
 
242 aa  324  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  62.61 
 
 
247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  56.49 
 
 
242 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  56.85 
 
 
249 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  59.17 
 
 
190 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  58.68 
 
 
176 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  57.06 
 
 
174 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  55.95 
 
 
175 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  54.82 
 
 
190 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  53.63 
 
 
190 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  54.71 
 
 
189 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.49 
 
 
175 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  54.17 
 
 
189 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  51.76 
 
 
182 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  51.76 
 
 
182 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  48.88 
 
 
188 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  50.9 
 
 
179 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  50.3 
 
 
175 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  49.41 
 
 
181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  50.82 
 
 
233 aa  164  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  46.2 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  45.76 
 
 
184 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  46.88 
 
 
160 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  48.41 
 
 
159 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.38 
 
 
167 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  45.57 
 
 
160 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  45.28 
 
 
162 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  47.2 
 
 
163 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  44.03 
 
 
157 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.04 
 
 
159 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 
160 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 
166 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  45.96 
 
 
161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  52.34 
 
 
168 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  51.09 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  42.77 
 
 
160 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  54.26 
 
 
192 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  43.48 
 
 
158 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  41.94 
 
 
162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  41.77 
 
 
160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  43.67 
 
 
161 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  44.72 
 
 
161 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  51.13 
 
 
168 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.71 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.21 
 
 
158 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  40.62 
 
 
161 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  40.76 
 
 
157 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  42.14 
 
 
161 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.38 
 
 
157 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  42.14 
 
 
160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  41.51 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  44.72 
 
 
161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.49 
 
 
157 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  49.62 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
185 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  42.14 
 
 
160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  43.37 
 
 
166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  42.14 
 
 
159 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  50 
 
 
168 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.59 
 
 
161 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  43.48 
 
 
161 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  39.49 
 
 
157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  40.25 
 
 
157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  40.25 
 
 
157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  40.25 
 
 
157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.38 
 
 
158 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  40.88 
 
 
159 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  43.12 
 
 
161 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  42.03 
 
 
161 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  38.61 
 
 
157 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
166 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  38.61 
 
 
157 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>