131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2136 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 73 aa  146  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  45.83 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.03 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  50 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  38.57 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.94 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.77 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.84 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  42.42 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  45.21 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.54 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  44.78 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.43 
 
 		 331 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  52.94 
 
 		 327 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  37.14 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.39 
 
 		 326 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0802  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.961569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.71 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.47 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.4 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  46 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  46 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>