More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1984 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  100 
 
 		 367 aa  740    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  33.86 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  34.33 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  33.23 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  28.53 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  27.56 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  29.53 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  27.79 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  27.95 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  32.02 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  29.74 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  31.2 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  31.91 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  29.05 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  27.32 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  32.36 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.87 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  30.37 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  30.06 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  29.88 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  29.74 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  28.95 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  30.91 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.91 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.91 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  26.32 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  29.46 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  29.46 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  29.46 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.91 
 
 		 314 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.91 
 
 		 314 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  30.56 
 
 		 317 aa  92.8  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.91 
 
 		 321 aa  92.8  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.91 
 
 		 314 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  26.32 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  30.91 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  28.94 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  31.13 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  27.27 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  29.31 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  28.65 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  26.74 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  29.12 
 
 		 342 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  28.77 
 
 		 356 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  28.14 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  28.99 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  27.22 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.03 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  28.74 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  28.73 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.61 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.91 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  29.13 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  28.06 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  26.37 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  27.3 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  26.93 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  29.36 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  29.78 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  29.78 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.91 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  27.02 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  27.59 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  28.49 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  26.78 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  26.2 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  29.55 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  27.22 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  26.65 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  28.61 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  25 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  27.39 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.19 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  30.1 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  24.87 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  25.98 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  26.76 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  26.54 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  24.19 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  25.93 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  25.93 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  27.22 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  27.22 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  26.45 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  26.53 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  26.54 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  27.1 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  26.95 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  27.55 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.33 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  26.93 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  29.77 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  28.7 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  26.14 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  27.27 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  27.25 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  23.58 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  26.42 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  26.14 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  26.99 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>