More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1919 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
363 aa  741    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  47.59 
 
 
338 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  42.78 
 
 
355 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  42.4 
 
 
334 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  41.79 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  46.42 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  45.71 
 
 
339 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  42.43 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  43.75 
 
 
331 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  40.91 
 
 
332 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  43.49 
 
 
337 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 
315 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  42.11 
 
 
377 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  42.67 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  44.16 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  41.04 
 
 
370 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
339 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 
339 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  41.18 
 
 
343 aa  242  9e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  42.76 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  42.69 
 
 
345 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  40.87 
 
 
338 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  42.69 
 
 
333 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  43.49 
 
 
339 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  42.76 
 
 
345 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  43.38 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  42.99 
 
 
332 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  39.82 
 
 
341 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  39.82 
 
 
363 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  44.52 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.22 
 
 
341 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  44.85 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  42.05 
 
 
339 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  43.42 
 
 
325 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  40.88 
 
 
316 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  37.83 
 
 
387 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  37.54 
 
 
346 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 
327 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  40.06 
 
 
358 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  42.05 
 
 
337 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  42.57 
 
 
331 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 
339 aa  225  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  38.17 
 
 
406 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 
339 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  41.27 
 
 
339 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 
400 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  37.87 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  40.65 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  40.65 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  41.9 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  44.32 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 
351 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  42.91 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.94 
 
 
329 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  38.89 
 
 
371 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 
343 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  43.5 
 
 
335 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.37 
 
 
357 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  40.25 
 
 
356 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 
343 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  40.71 
 
 
331 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
345 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
345 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  42.59 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  40.73 
 
 
345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  41.99 
 
 
349 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  40.91 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  41.67 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  39.69 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  40.32 
 
 
336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  42.18 
 
 
427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
467 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
467 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>