More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1897 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  100 
 
 		 347 aa  704    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  56.19 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  51.7 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  48.82 
 
 		 343 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  51.7 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  52.41 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  50.29 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  49 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  51.47 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  51.4 
 
 		 348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  48.67 
 
 		 340 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  49.7 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  48.21 
 
 		 339 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  48.85 
 
 		 353 aa  321  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  52.63 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  48.65 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  48.82 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  47.92 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  48.52 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  50.74 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  48.99 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  50.87 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  50 
 
 		 353 aa  316  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  50.87 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  50.87 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  44.11 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  51.02 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  51.02 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  51.47 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  50.73 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  50.73 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  50.73 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  52.89 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  50.73 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  48.52 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  51.19 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  50.44 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  53.8 
 
 		 347 aa  308  8e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  51.31 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  51.31 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  51.31 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  51.31 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  48.29 
 
 		 353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  49.7 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  51.02 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  50.44 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  46.61 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  49.11 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.15 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  49.85 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  48.52 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  49.7 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  48.52 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  50.43 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  48.82 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  49.7 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  51.17 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  46.31 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  51.15 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  50.29 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  49.26 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  49.26 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  47.06 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  47.01 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  46.99 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  54.64 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  50.32 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  46.27 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  45.02 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  51.17 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  50.84 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  51.37 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  46.97 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  48.52 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  50.5 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  57.99 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  53.28 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  63.68 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  52.74 
 
 		 216 aa  193  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  53.03 
 
 		 234 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.64 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.13 
 
 		 269 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.76 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.87 
 
 		 270 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  28.19 
 
 		 269 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.32 
 
 		 625 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  28.08 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  28.45 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  28.99 
 
 		 609 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.66 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  38.06 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12241  predicted protein  49.5 
 
 		 101 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0687182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  34.34 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  31.34 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  34.55 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  32.02 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  31.28 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.16 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.42 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.01 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>