209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1823 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1823  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
344 aa  706    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.76 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.91 
 
 
348 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  33.57 
 
 
348 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.18 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  32.47 
 
 
313 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  33.01 
 
 
313 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4298  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.94 
 
 
313 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0047  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.61 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.21464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  29.36 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.93 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1330  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.4 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  29.49 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  31.63 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  29 
 
 
356 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3414  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.39 
 
 
304 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215504  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1041  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  28.48 
 
 
349 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255858  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1946  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.9 
 
 
317 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  28.79 
 
 
345 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1876  folate-binding protein YgfZ  29.11 
 
 
319 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0515526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2265  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  29.39 
 
 
361 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1782  hypothetical protein  28.33 
 
 
346 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000345252  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1463  GcvT-like aminomethyltransferase  30.54 
 
 
313 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0953124  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.52 
 
 
344 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.52 
 
 
344 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2521  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.8 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0149913  hitchhiker  0.00318223 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.9 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.9 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  29.79 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4132  putative aminomethyltransferase  29.43 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.510492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.71 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.73 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1989  folate-binding protein YgfZ  27.22 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1715  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.22 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.59 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54480  hypothetical protein  30.06 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812982 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0881  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.15 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1937  folate-binding protein YgfZ  28.12 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1918  folate-binding protein YgfZ  26.67 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.208988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  30.31 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2253  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.78 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2860  folate-binding protein YgfZ  28.15 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3962  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.8 
 
 
315 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.812707  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4228  hypothetical protein  28.3 
 
 
315 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.05 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.67 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4761  hypothetical protein  29.84 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2152  glycine cleavage T-protein superfamily protein  27.83 
 
 
348 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2322  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.15 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1427  hypothetical protein  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2445  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  30.27 
 
 
279 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1918  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3386  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2283  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1191  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.72 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0968  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.95 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.776071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1003  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.16 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  27.65 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13620  ygfZ-like protein  29.13 
 
 
315 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3948  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.95 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.828839  normal  0.672374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3198  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.58 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  30.32 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  31.13 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.1 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3386  folate-binding protein YgfZ  28.67 
 
 
315 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00306542  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2255  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
322 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.333338  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3890  folate-binding protein YgfZ  27.2 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00117726  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0630  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.82 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.31258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1862  hypothetical protein  29.25 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.171418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.94 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  30.51 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0717  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.42 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822858  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.26 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0861  hypothetical protein  26.54 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  26.67 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002488  glycine cleavage T-protein  26.98 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.923355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0837  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.58 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3503  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  25.91 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0872  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.36 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3385  putative global regulator  26.89 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3280  putative global regulator  27.16 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3283  putative global regulator  27.16 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3205  putative global regulator  27.16 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3217  putative global regulator  27.16 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.87 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3140  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0557  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.67 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.84 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1085  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.66 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000414438  hitchhiker  0.0000000121971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  32.7 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1533  folate-binding protein YgfZ  29 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3160  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.16 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3305  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.15 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28552  predicted protein  27.64 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177666  hitchhiker  0.000000277252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2049  hypothetical protein  25.23 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>