More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1813 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.51 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 245 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.26 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.4 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.4 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  52.4 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  51.97 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  53.22 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  52.4 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.81 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.04 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  51.97 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  51.04 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.35 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  52.23 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  50.88 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  50.44 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.66 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  50.88 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  50.88 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  50.44 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  49.57 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  49.56 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  50 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  50 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  50 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  50 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  50 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  50.44 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 251 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  49.15 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  53.96 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  49.57 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  50 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  47.66 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  50.43 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  48.73 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>