107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1783 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.27 
 
 
210 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  43.06 
 
 
214 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  43.56 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.89 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  41.96 
 
 
208 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.49 
 
 
233 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.53 
 
 
217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.47 
 
 
220 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.51 
 
 
222 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  39.38 
 
 
215 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  40.47 
 
 
212 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  40.18 
 
 
220 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  36.99 
 
 
212 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.93 
 
 
205 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  35.62 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.89 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  41.5 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  50 
 
 
222 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  52.27 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.92 
 
 
219 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.33 
 
 
233 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  56.45 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.94 
 
 
211 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  36.76 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  37.5 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  35.55 
 
 
212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  39 
 
 
208 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  39 
 
 
208 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  39 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  36.99 
 
 
212 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.39 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  37.04 
 
 
208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  37.04 
 
 
208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  37.04 
 
 
208 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.15 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  39.9 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  33.21 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  37.44 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.04 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  36.97 
 
 
210 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  36.02 
 
 
212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.91 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  33.5 
 
 
208 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.48 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  38.5 
 
 
208 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.8 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  37.32 
 
 
206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  36.84 
 
 
206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  36.84 
 
 
206 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  36.84 
 
 
206 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  36.84 
 
 
206 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  35.89 
 
 
209 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.51 
 
 
229 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  35.32 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.41 
 
 
229 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.36 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  36.36 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  36.36 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  36.36 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.74 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  35.89 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  36.45 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.21 
 
 
211 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  35.41 
 
 
206 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  34.87 
 
 
207 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  35.41 
 
 
206 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  35.41 
 
 
206 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  45.9 
 
 
207 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  49.12 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  34.83 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  33.5 
 
 
209 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  33.5 
 
 
209 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  55.32 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.41 
 
 
200 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.64 
 
 
222 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.78 
 
 
200 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.75 
 
 
200 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.28 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  31.48 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.55 
 
 
222 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.17 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.77 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.59 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.6 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.1 
 
 
178 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.94 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39 
 
 
197 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.99 
 
 
368 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.82 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.39 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.64 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  33.94 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2828  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.26 
 
 
196 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.061366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.69 
 
 
185 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  34.78 
 
 
185 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.64 
 
 
190 aa  45.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>