More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1755 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  40.42 
 
 
287 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  44.25 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  40.42 
 
 
287 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  43.49 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  40.97 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  41.1 
 
 
290 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  42.47 
 
 
290 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  43.84 
 
 
289 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  40.99 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  42.66 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  40.28 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  41.58 
 
 
289 aa  211  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 
286 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  40.14 
 
 
280 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  40.57 
 
 
291 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  39.58 
 
 
290 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  40.07 
 
 
290 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.93 
 
 
282 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  40.07 
 
 
280 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  42.01 
 
 
285 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.86 
 
 
280 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.71 
 
 
282 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  40.94 
 
 
282 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  39.71 
 
 
282 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  42.66 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.71 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  41.61 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.48 
 
 
281 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  39.35 
 
 
282 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  40.91 
 
 
285 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  38.32 
 
 
310 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.13 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.01 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  39.01 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  39.01 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.71 
 
 
282 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.65 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.46 
 
 
286 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.15 
 
 
918 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  36.75 
 
 
274 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.73 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  38.03 
 
 
302 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.15 
 
 
320 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.78 
 
 
302 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.72 
 
 
324 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  37.32 
 
 
302 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.33 
 
 
285 aa  175  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.88 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  35.17 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.97 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.41 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.38 
 
 
324 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.92 
 
 
289 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.92 
 
 
289 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  36.14 
 
 
324 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.06 
 
 
329 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  34.36 
 
 
334 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.49 
 
 
287 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.11 
 
 
269 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  35.15 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  34.91 
 
 
277 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  34.91 
 
 
302 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.21 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.19 
 
 
302 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  37.19 
 
 
302 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.21 
 
 
326 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.92 
 
 
317 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  34.04 
 
 
326 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  32.67 
 
 
311 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  36.49 
 
 
300 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  34.15 
 
 
271 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.98 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  35.46 
 
 
306 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  35.92 
 
 
302 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  33.68 
 
 
306 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  32.47 
 
 
286 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.21 
 
 
341 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  36.9 
 
 
318 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.97 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.6 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.6 
 
 
303 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  32.52 
 
 
315 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  35.11 
 
 
304 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  33.7 
 
 
314 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  28.87 
 
 
272 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  28.87 
 
 
272 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  32.65 
 
 
310 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
303 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.27 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  36.07 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  34.75 
 
 
304 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  32.39 
 
 
312 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  34.75 
 
 
304 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.18 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>