More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1730 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 
137 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  36.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  38.81 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
142 aa  82.8  1e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
140 aa  82  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
143 aa  82.4  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
143 aa  82  3e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
141 aa  81.6  3e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  34.56 
 
 
143 aa  81.6  3e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 
140 aa  81.6  3e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
142 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
144 aa  81.3  4e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
141 aa  80.1  1e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
141 aa  80.1  1e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
141 aa  80.1  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
140 aa  79.3  2e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  37.23 
 
 
143 aa  79.3  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
141 aa  79  2e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  34.56 
 
 
142 aa  79  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 
149 aa  77.4  7e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
158 aa  77  7e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
142 aa  76.3  1e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
136 aa  76.3  1e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
144 aa  75.9  2e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
140 aa  74.7  3e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
142 aa  74.7  4e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
142 aa  74.3  5e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.07 
 
 
141 aa  71.6  3e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  35.25 
 
 
143 aa  71.6  4e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  30.95 
 
 
146 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.04 
 
 
138 aa  70.1  9e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
147 aa  70.1  9e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  30.95 
 
 
146 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 
122 aa  69.3  2e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
131 aa  68.9  2e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
135 aa  68.2  4e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.8 
 
 
152 aa  67.8  5e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
133 aa  67.4  6e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
137 aa  66.6  9e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
141 aa  66.6  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.58 
 
 
136 aa  66.2  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
140 aa  66.6  1e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
126 aa  65.5  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.79 
 
 
140 aa  65.1  3e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
132 aa  65.1  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
144 aa  65.1  3e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.59 
 
 
132 aa  65.1  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.34 
 
 
133 aa  64.7  4e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
133 aa  64.7  4e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
142 aa  64.7  5e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.83 
 
 
134 aa  63.9  6e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
141 aa  64.3  6e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.07 
 
 
132 aa  63.5  9e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
135 aa  63.5  9e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  34.07 
 
 
132 aa  63.5  9e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
136 aa  63.2  1e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  28.57 
 
 
134 aa  63.5  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
158 aa  63.2  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
130 aa  62.4  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.09 
 
 
134 aa  62.4  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  29.01 
 
 
136 aa  62.8  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 
146 aa  62.4  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
134 aa  62  2e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  26.52 
 
 
135 aa  62.4  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 
134 aa  62.4  2e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
145 aa  62  3e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 
139 aa  61.6  3e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
134 aa  61.6  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  30.16 
 
 
143 aa  61.6  3e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  32.59 
 
 
138 aa  61.6  3e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
156 aa  61.2  4e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
139 aa  61.6  4e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  33.08 
 
 
154 aa  61.2  4e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  29.27 
 
 
134 aa  61.6  4e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
135 aa  61.2  4e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
134 aa  61.2  4e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
141 aa  61.2  4e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
134 aa  60.8  6e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  6.99577e-08 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  30.4 
 
 
135 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
134 aa  60.8  6e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
134 aa  60.8  6e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
134 aa  60.5  7e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
140 aa  60.5  8e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
134 aa  60.5  8e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
134 aa  60.5  8e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
145 aa  60.5  8e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  33.83 
 
 
145 aa  60.5  8e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.82 
 
 
135 aa  60.5  9e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
156 aa  59.7  1e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 
135 aa  59.7  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  60.1  1e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  60.1  1e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
149 aa  59.7  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30 
 
 
137 aa  59.7  1e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>