267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1653 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 165 aa  343  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  48.72 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1926  dihydrofolate reductase  47.4 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.51 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.96 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  42.55 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.22 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  39.87 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  35.44 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 		 219 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  34.18 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  42.04 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.18 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  45.21 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  39.13 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  36.59 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  38.95 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  39.75 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 292 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  42.55 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  43.84 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.19 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  39.47 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  38.79 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  38.95 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.96 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  35.98 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  36.47 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  38.04 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>