240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1514 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  100 
 
 
472 aa  956    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  39.78 
 
 
452 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  38.46 
 
 
451 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  45.63 
 
 
447 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  38.64 
 
 
439 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  35.79 
 
 
459 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  34.27 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  37.14 
 
 
422 aa  206  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  39.45 
 
 
430 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  30.97 
 
 
446 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  33.33 
 
 
446 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  35.13 
 
 
397 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  32.82 
 
 
479 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  33.08 
 
 
449 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  34.06 
 
 
417 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  32.61 
 
 
425 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  38.69 
 
 
473 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  29.38 
 
 
450 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  30.26 
 
 
451 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  31.25 
 
 
442 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  31.05 
 
 
499 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  27.77 
 
 
487 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  27.82 
 
 
411 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  30.17 
 
 
434 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  35.82 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  35.82 
 
 
337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  35.82 
 
 
337 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  34.32 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  34.66 
 
 
297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  34.81 
 
 
444 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  34.8 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  35.71 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  30.08 
 
 
429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  35.71 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  26.61 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  35.71 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  28.83 
 
 
439 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  30.66 
 
 
439 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  35.34 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  27.32 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  35.23 
 
 
285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  35 
 
 
298 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  33.21 
 
 
447 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  31.48 
 
 
417 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  29.71 
 
 
437 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  31.84 
 
 
310 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  30.41 
 
 
436 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  29.43 
 
 
439 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  34.47 
 
 
320 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  32.98 
 
 
313 aa  123  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  32.27 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  32.23 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  32.25 
 
 
429 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  31.13 
 
 
561 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  31.95 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  31.5 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  29.36 
 
 
424 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  29.56 
 
 
437 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  29.56 
 
 
437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  29.56 
 
 
437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  29.56 
 
 
437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  29.56 
 
 
437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  32.03 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  27.41 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  34.14 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  33.56 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  33.7 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  33.73 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  32.73 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  32.31 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  33.09 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  34.01 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  33.09 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  29.19 
 
 
443 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  30.42 
 
 
426 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  33.7 
 
 
442 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
442 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  33.09 
 
 
303 aa  113  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  30.71 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  29.56 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  29.56 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  28.21 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  30.31 
 
 
412 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  31.05 
 
 
443 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.1 
 
 
437 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  31.56 
 
 
408 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  24.95 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  30.47 
 
 
446 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.61 
 
 
416 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  30.82 
 
 
443 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  30.11 
 
 
525 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  30.11 
 
 
525 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  31.91 
 
 
432 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 
538 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  25 
 
 
405 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  31.92 
 
 
314 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  27.22 
 
 
404 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  33.2 
 
 
292 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  27.7 
 
 
448 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  33.33 
 
 
288 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>