More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1453 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  68.15 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  61.72 
 
 		 292 aa  360  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  62.89 
 
 		 294 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  60.9 
 
 		 289 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  60.42 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  61.3 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  56.7 
 
 		 292 aa  328  9e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  56.36 
 
 		 292 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  53.92 
 
 		 302 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  57.29 
 
 		 292 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  55.1 
 
 		 292 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  55.1 
 
 		 292 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  54.08 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  54.08 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  55.36 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  56.18 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  54.48 
 
 		 285 aa  289  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  53.12 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  56.79 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  54.14 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  53.12 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  54.14 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  54.14 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  54.14 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  53.96 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  53.1 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  53.05 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  52.41 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  52.41 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  52.41 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  52.74 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  52.41 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  51.7 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  52.13 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.71 
 
 		 289 aa  271  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  52.41 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  53.26 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  50.89 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  51.36 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  52.07 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  51.7 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  53.85 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  51.03 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  53.36 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  53.36 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  51.21 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  48.04 
 
 		 293 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  48.04 
 
 		 293 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  48.4 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  52.45 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.3 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  48.75 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  48.39 
 
 		 308 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  48.87 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.32 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  49.35 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  48.39 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.32 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  46.94 
 
 		 291 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  53.85 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  48.16 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  52.13 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>