More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1286 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1286  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  100 
 
 
731 aa  1492    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  23.03 
 
 
1177 aa  89  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
695 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  22.4 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
935 aa  81.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  26.88 
 
 
1255 aa  81.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 
1022 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 
1331 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  24.86 
 
 
955 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
823 aa  79  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
816 aa  78.2  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
841 aa  77.8  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.48 
 
 
1333 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.22 
 
 
936 aa  77.4  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
1326 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 
129 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1155 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1161 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1149 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1155 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1155 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  24.13 
 
 
949 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1070 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 
1180 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  24.13 
 
 
957 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  24.13 
 
 
949 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
945 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1942 aa  74.7  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.72 
 
 
950 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
806 aa  74.7  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
1165 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  33.61 
 
 
678 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
1122 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
877 aa  73.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1406 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
781 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  23.08 
 
 
957 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1303 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
121 aa  73.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
1287 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.89 
 
 
932 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.89 
 
 
933 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
1059 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.89 
 
 
933 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.89 
 
 
933 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  31.43 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  33.1 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
720 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 
234 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.66 
 
 
767 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1651 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
721 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
829 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
123 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1237 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  31.01 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
995 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.82 
 
 
715 aa  71.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1155 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
774 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1007 aa  70.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1201 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
1156 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
915 aa  70.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  32.06 
 
 
600 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
909 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  36.29 
 
 
232 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.77 
 
 
354 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
606 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
122 aa  70.5  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1622 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.44 
 
 
1436 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  27.12 
 
 
122 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 
1258 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.78 
 
 
1014 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1203 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 
227 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  30.23 
 
 
1346 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 
121 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 
226 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  27.73 
 
 
121 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  25.98 
 
 
718 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.15 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1118 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.96 
 
 
935 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 
1245 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.96 
 
 
935 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1333 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  22.29 
 
 
949 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  27.73 
 
 
121 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  22.29 
 
 
949 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  22.29 
 
 
949 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.89 
 
 
1442 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1074 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  26.72 
 
 
1626 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  30.85 
 
 
570 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>