More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1072 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  34.16 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  25 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  29.87 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  29.22 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  33.07 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
885 aa  69.3  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  34.11 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  27.04 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  34.75 
 
 
698 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
875 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.94 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.8 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.34 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  30.38 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  30.67 
 
 
883 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.82 
 
 
504 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.65 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.15 
 
 
152 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.71 
 
 
427 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 
863 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
859 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
863 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
500 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
279 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.14 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.83 
 
 
888 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.92 
 
 
875 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.67 
 
 
909 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.11 
 
 
865 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  34.88 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.33 
 
 
153 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  33.77 
 
 
413 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
490 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
427 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  28.45 
 
 
155 aa  62  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.76 
 
 
147 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
867 aa  62  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
490 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  33.61 
 
 
189 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  33.61 
 
 
189 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  33.61 
 
 
189 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.67 
 
 
845 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.4 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.5 
 
 
489 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
873 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
258 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  31.29 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.13 
 
 
875 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.08 
 
 
877 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  32.23 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.61 
 
 
493 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
688 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.62 
 
 
494 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.85 
 
 
500 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  32.47 
 
 
413 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.17 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.54 
 
 
486 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.83 
 
 
907 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
490 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 
149 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 
877 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  31.45 
 
 
158 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  30 
 
 
320 aa  58.9  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  32.47 
 
 
412 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
483 aa  58.5  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 
620 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34 
 
 
484 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.4 
 
 
490 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.17 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  30.23 
 
 
139 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.89 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.08 
 
 
495 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.38 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0196  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
490 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.2 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  24.59 
 
 
492 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  25.69 
 
 
389 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 
389 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.16 
 
 
489 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  26.75 
 
 
383 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.54 
 
 
485 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>