More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0995 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
547 aa  1127    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  57.14 
 
 
552 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  60.52 
 
 
548 aa  683    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  57.12 
 
 
531 aa  631  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 
548 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  56.17 
 
 
548 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  56.17 
 
 
548 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  56.17 
 
 
548 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  55.99 
 
 
549 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  57.4 
 
 
547 aa  627  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  54.09 
 
 
549 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  55.37 
 
 
546 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  55.68 
 
 
549 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  53.33 
 
 
567 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  54.39 
 
 
550 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  55.49 
 
 
549 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  55.84 
 
 
548 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  56.72 
 
 
549 aa  621  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  54.88 
 
 
549 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 
560 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  54.7 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
549 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
549 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
549 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  53.63 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  54.83 
 
 
548 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 
549 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 
549 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.17 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  54.23 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  55.62 
 
 
550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  54.17 
 
 
550 aa  598  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  53.86 
 
 
548 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
552 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  53.01 
 
 
547 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  51.55 
 
 
554 aa  594  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 
550 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  57.89 
 
 
547 aa  589  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  52.41 
 
 
550 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  52.7 
 
 
550 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 
562 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 
551 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 
545 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 
545 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
545 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  51.19 
 
 
548 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
545 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
545 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  52.14 
 
 
549 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  53.35 
 
 
559 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  50.93 
 
 
545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 
547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  51.38 
 
 
545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  54.1 
 
 
541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
545 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  53.99 
 
 
649 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.96 
 
 
543 aa  565  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
553 aa  566  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
545 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
548 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 
543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  54.06 
 
 
554 aa  561  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
545 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  52.78 
 
 
543 aa  559  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  53.04 
 
 
549 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
548 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  52.33 
 
 
539 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  52.55 
 
 
553 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  53.28 
 
 
549 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  53.28 
 
 
549 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  52.33 
 
 
545 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  48.7 
 
 
547 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  51.4 
 
 
539 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  51.38 
 
 
541 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  47.97 
 
 
549 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  51.09 
 
 
546 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 
541 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 
549 aa  548  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 
545 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  51.62 
 
 
541 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  49.73 
 
 
556 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  53 
 
 
541 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 
539 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 
553 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1020  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 
546 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  51.58 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>