37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0975 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  63.49 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  56.72 
 
 		 72 aa  85.9  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  55.38 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  41.94 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  37.5 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 89 aa  57  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2024  hypothetical protein  33.78 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.217828  decreased coverage  0.000000018107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2136  putative transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  36.49 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  30.3 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3923  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.551914  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>