230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0955 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0955  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.3545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10098  oxidoreductase  43.8 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.32 
 
 
301 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.48 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.2 
 
 
300 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  28.36 
 
 
304 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.73 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  30.68 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  28.47 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  28.95 
 
 
291 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  27.61 
 
 
295 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  29.15 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  29.48 
 
 
298 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  29.8 
 
 
299 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  28.57 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  28.57 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  29.1 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  29.8 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  27.88 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  29.41 
 
 
299 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  26.77 
 
 
302 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  26.87 
 
 
308 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  29.46 
 
 
308 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  29.46 
 
 
308 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  27.44 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  29.08 
 
 
299 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.44 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.04 
 
 
287 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  26.49 
 
 
299 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9237  taurine dioxygenase  27.82 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  27.73 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  25.75 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  27.27 
 
 
281 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  29.28 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  25.94 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  25.56 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  24.25 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.41 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  23.53 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  26.69 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  26.16 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  26.69 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  27.31 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  25.83 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  24.9 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  25.09 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  24.9 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  27.06 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  24.9 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  24.11 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  25 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  25.83 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  25.83 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  26.57 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  26.57 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  26.57 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  26.57 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  26.57 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  24.29 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  27.73 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.9 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  28.12 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  24.4 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  27.67 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  24.69 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  24.64 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  23.57 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  26.18 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  26.29 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  26.67 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.44 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  26.69 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  26.64 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  25.62 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  25.27 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  31.14 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.48 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  25.3 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.6 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  20.53 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  27.43 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34422  predicted protein  25.35 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.516584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  24.06 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11090  TfdA family taurine dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17170)  25.81 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  27.18 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  31.76 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  26.62 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  25.77 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  24.71 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  25.81 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  25.53 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  26.94 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  24.6 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  24.9 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>