59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0895 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0895  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  28.18 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  25.84 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  29.14 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  31.87 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  32.03 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  27.07 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  29.75 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  26.75 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  28.34 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  27.85 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  26.75 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  27.5 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  26.88 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  26.9 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  24.85 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  29.11 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  27.49 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  29.41 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3292  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00367172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3230  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000337238  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3218  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000450818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3397  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000126267  normal  0.501015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3295  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00388648  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  24.43 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  25.95 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  27.92 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  30.1 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  30.1 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  28.57 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  31.1 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  29.13 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  30.49 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  30.49 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  30.49 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  30.49 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2765  YecA family protein  25.14 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  25.75 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0859  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3826  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232648  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0862  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000942721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2724  YgfB and YecA  29.11 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  30.72 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000512216  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  31.52 
 
 
191 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000645729  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0783  yecA family protein  28.49 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000863734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3043  hypothetical protein  28.49 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000773982  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3330  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000429814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0800  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000300982  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3237  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000591156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3068  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000388648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4202  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644534  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  30.3 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02704  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000286708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02741  hypothetical protein  28.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000279044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3514  hypothetical protein  25.93 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00932304  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02379  hypothetical protein  30.83 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3328  hypothetical protein  28.73 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002483  hypothetical protein  23.84 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000288403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2053  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>